公司收取保证金是不合法的。根据相关法律规定，若是有此种行为的，会被责任退还给本人，还会罚款的行政处罚。根据相关法律规定，给劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任。
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法律对此没有明确规定，需要根据双方签订合同来确定