16岁被刑事拘留是否算案底，需视具体情况而定.如果案件经公安机关侦查后撤销，或检察院审查起诉时作出不起诉决定，又或法院判决无罪，那么该16岁未成年人是无案底的.若其被法院判刑，即使是缓刑，也会有案底.不过，依据《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十六条，犯罪时不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，相关犯罪记录会被封存.