在处理医疗事故损害赔偿纠纷时，若双方选择协商方式解决，根据《医疗事故处理条例》的相关规定，双方协商后制作的协议书需明确赔偿数额、赔偿方式、赔偿期限等关键条款，以确保协议内容的完整性和明确性。这些要素是协议书具有法律效力的基础，也是双方权益得到有效保障的关键。双方应仔细审查协议内容，并在自愿、平等的基础上签署，以避免后续争议。
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从法律角度看，医疗事故损害赔偿纠纷的诉讼主体主要包括患者及其近亲属和医疗机构。患者作为直接受害人，有权提起诉讼；若患者死亡或无法行使诉讼权利，其近亲属可作为诉讼主体。医疗机构则作为赔偿责任的潜在承担者，在诉讼中承担相应的法律责任。
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若协商和调解均无法达成医疗事故损害赔偿纠纷的解决方案，双方当事人可采取诉讼方式解决。具体操作包括：准备充分的证据材料，向法院提起诉讼；在诉讼过程中，积极参与法庭调查、辩论等环节，维护自身合法权益；根据法院审理结果，履行判决或裁定。